植物的大部分營養和水分都是通過根部于土壤進行物質交換完成的，因此根系的生長狀態對于植物的影響非常大，研究根系形態對于農業發展而言非常重要，不過根系屬于植物“隱藏的一半”，要對其開展研究工作是有一定的難度的，而隨著科技的發展，根系分析儀被應用到了植物根系研究當中，研究人員使用它來開展工作，讓根系研究變得更輕松，也更有效率。
    當然，在根系分析儀出現前，也有學者對植物根系進行研究的，只是以前植物根系研究者在進行根系研究的時候，受到很多外在因素的影響，導致根系研究的進程非常緩慢。而現在有了根系分析儀之后，讓研究者更加方便的開展工作，根系分析系統大批量的全自動根系分析，可對各自動分析結果圖進行編輯修正；能進行根的分叉裁剪、合并、連接等修正，修正操作能回退，以快速獲得100%正確的結果。根系分析系統測量項目主要有，根總長；根平均直徑；根總面積；根總體積；根尖計數；分叉計數；交疊計數；根直徑等級分布參數；可不等間距地自定義分段直徑，自動測量各直徑段長度、投影面積、表面積、體積等，及其分布參數；根尖段長分布。  
    托普云農的根系分析儀可以定量測定根總長；根平均直徑；根總面積；根總體積；根尖計數；分叉計數；交疊計數；根直徑等級分布參數等指標，使用根系分析儀開展的相關工作，成效也是非常明顯的，例如在水稻根系形態特征指標定量分析過程中，通過測定發現，增施氮肥可促進根系生長，明顯提高不定根比例；適當控水可促進根系生長明顯提高分枝根比例。因此利用它來進一步優化水肥的配比，促進作物的健康成長，是卓有成效的。
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