一、自我評價
企業對照《高新技術企業認定管理辦法》和《高新技術企業認定管理工作指引》進行自我評價。符合認定條件的按照有關規定和要求進行申報。
二、注冊登記
企業登錄“高新技術企業認定管理工作網”，按要求真實、完整的填寫《企業注冊登記表》，保存后提交科技部火炬中心進行認證。企業注冊信息經火炬中心審核通過后，企業即可開展后續網上填報工作。已完成注冊的企業，不能重復進行注冊，須用原有的用戶名和密碼登陸。
企業用戶名和密碼在以后更名、年報、申報中會經常用到，請妥善保管。用戶名和密碼丟失的，可登陸“高新技術企業認定管理工作網”，通過“申報管理—個人/企業—找回密碼”功能進行找回。
三、網上填報
企業登陸“高新技術企業認定管理網”，按要求在線填寫《高新技術企業認定申請書》，上傳相關附件，確認無誤后在規定的時間內通過網絡系統提交至受理機構。
四、提交紙質材料
企業將《高新技術企業認定申請書》和附件材料裝訂成冊后報送至本地區組織推薦單位。企業向組織推薦單位提交申請材料的截止時間以地方通知為準。
五、組織推薦
各市科技部門、山西轉型綜改示范區是本地區高新技術企業認定的組織推薦單位，對本地區高新技術企業認定申請材料應進行形式審查，必要時可邀請同級財稅部門進行聯合評價，并實地考察。形式審查確認申請材料完備、真實后，出具推薦函和推薦匯總表上報省高企認定辦公室。
六、專家評審
對組織推薦單位上報的企業申請材料，省高企認定管理機構按照《高新技術企業認定管理辦法》和《高新技術企業認定管理工作指引》要求，組織專家進行評審。
七、綜合審查
省高企認定管理機構對通過專家評審的企業，抽取一定比例進行綜合審查，提出綜合審查意見，必要時會對部分企業進行實地核查。
八、報備公示
省高企認定管理機構將符合認定條件的企業報送全國高新技術企業認定管理領導小組辦公室備案。 認定報備企業名單在國家“高新技術企業認定管理工作網”公示10個工作日。
九、認定公告
省高新技術企業認定管理機構依據全國高新技術企業認定領導小組辦公室備案批復，聯合下發認定文件，并在“山東省科技廳網站”公告。
十、證書發放
省高企辦將認定文件、統一印制的“高新技術企業證書”發至各組織推薦單位。